Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OXCT1P55809 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
OXCT1P55809 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms