Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSNK1A1P48729 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSNK1A1P48729 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSNK1A1P48729 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSNK1A1P48729 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSNK1A1P48729 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSNK1A1P48729 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSNK1A1P48729 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSNK1A1P48729 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSNK1A1P48729 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSNK1A1P48729 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms