Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX19P40855 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX19P40855 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX19P40855 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX19P40855 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX19P40855 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX19P40855 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX19P40855 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX19P40855 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX19P40855 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX19P40855 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX19P40855 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX19P40855 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX19P40855 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX19P40855 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX19P40855 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX19P40855 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX19P40855 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX19P40855 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX19P40855 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX19P40855 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX19P40855 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX19P40855 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX19P40855 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX19P40855 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX19P40855 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX19P40855 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX19P40855 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX19P40855 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX19P40855 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX19P40855 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX19P40855 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX19P40855 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX19P40855 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX19P40855 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX19P40855 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX19P40855 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX19P40855 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX19P40855 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX19P40855 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX19P40855 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX19P40855 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX19P40855 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX19P40855 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX19P40855 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX19P40855 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX19P40855 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX19P40855 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX19P40855 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX19P40855 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX19P40855 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX19P40855 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PEX19P40855 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX19P40855 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX19P40855 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX19P40855 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX19P40855 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX19P40855 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX19P40855 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX19P40855 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX19P40855 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX19P40855 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX19P40855 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX19P40855 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX19P40855 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX19P40855 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX19P40855 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX19P40855 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX19P40855 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX19P40855 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX19P40855 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX19P40855 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX19P40855 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX19P40855 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX19P40855 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX19P40855 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX19P40855 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX19P40855 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX19P40855 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX19P40855 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX19P40855 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX19P40855 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX19P40855 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX19P40855 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX19P40855 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX19P40855 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX19P40855 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX19P40855 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX19P40855 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX19P40855 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX19P40855 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX19P40855 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX19P40855 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX19P40855 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX19P40855 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX19P40855 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX19P40855 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX19P40855 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms