Protein–RNA interactions for Protein: P40501

AVT7, Vacuolar amino acid transporter 7, yeastyeast

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT7P40501 KKQ8YKL168C 2175 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT7P40501 DOT5YIL010W 648 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT7P40501 RRS1YOR294W 612 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT7P40501 VMA4YOR332W 702 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT7P40501 SKS1YPL026C 1509 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT7P40501 HST3YOR025W 1344 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT7P40501 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT7P40501 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT7P40501 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT7P40501 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT7P40501 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT7P40501 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT7P40501 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT7P40501 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT7P40501 GCV3YAL044C 513 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT7P40501 MRPS12YNR036C 462 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT7P40501 QNS1YHR074W 2145 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT7P40501 KDX1YKL161C 1302 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT7P40501 SKN1YGR143W 2316 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT7P40501 ICL1YER065C 1674 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT7P40501 RPN11YFR004W 921 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT7P40501 YIL077CYIL077C 963 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT7P40501 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT7P40501 YFL042CYFL042C 2025 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT7P40501 FRS2YFL022C 1512 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT7P40501 YEL020CYEL020C 1683 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT7P40501 NSE5YML023C 1671 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT7P40501 RPS5YJR123W 678 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT7P40501 RPL10YLR075W 666 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT7P40501 TSA1YML028W 591 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT7P40501 YNR040WYNR040W 771 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT7P40501 RPN7YPR108W 1290 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT7P40501 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT7P40501 LSG1YGL099W 1923 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT7P40501 FZF1YGL254W 900 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT7P40501 LDS1YAL018C 978 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT7P40501 YHM2YMR241W 945 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT7P40501 GAT1YFL021W 1533 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT7P40501 CHS5YLR330W 2016 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT7P40501 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT7P40501 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT7P40501 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT7P40501 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT7P40501 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT7P40501 SNN1YNL086W 309 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT7P40501 YTH1YPR107C 627 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT7P40501 LDB19YOR322C 2457 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT7P40501 UTP4YDR324C 2331 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT7P40501 GPA2YER020W 1350 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT7P40501 YDL129WYDL129W 876 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT7P40501 YEL068CYEL068C 333 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT7P40501 ECM19YLR390W 339 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT7P40501 ATF1YOR377W 1578 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT7P40501 MCM6YGL201C 3054 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT7P40501 AMA1YGR225W 1782 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT7P40501 CLB1YGR108W 1416 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT7P40501 KEX2YNL238W 2445 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT7P40501 EGD2YHR193C 525 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT7P40501 TAL1YLR354C 1008 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT7P40501 MRPS16YPL013C 366 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT7P40501 PTK2YJR059W 2457 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 ALD6YPL061W 1503 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 MPA43YNL249C 1629 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 RAD3YER171W 2337 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 GPB2YAL056W 2643 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 CDC34YDR054C 888 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 YLR126CYLR126C 756 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 JNM1YMR294W 1122 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 YPR114WYPR114W 948 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 SPS22YCL048W 1392 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 ELP3YPL086C 1674 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 MCM3YEL032W 2916 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 HXT15YDL245C 1704 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 HXT16YJR158W 1704 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT7P40501 ERP5YHR110W 639 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT7P40501 SHP1YBL058W 1272 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT7P40501 YOL131WYOL131W 327 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT7P40501 XBP1YIL101C 1944 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT7P40501 MDM31YHR194W 1740 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT7P40501 HIS7YBR248C 1659 nt5.21□□□□□ -1.57
AVT7P40501 HSP78YDR258C 2436 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT7P40501 YDL172CYDL172C 480 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT7P40501 HAP2YGL237C 798 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT7P40501 YJU3YKL094W 942 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT7P40501 PUS5YLR165C 765 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT7P40501 YFR006WYFR006W 1608 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT7P40501 CMR1YDL156W 1569 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT7P40501 YFL052WYFL052W 1398 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT7P40501 STE13YOR219C 2796 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT7P40501 YDL144CYDL144C 1071 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT7P40501 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT7P40501 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT7P40501 ATG4YNL223W 1485 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT7P40501 GAA1YLR088W 1845 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT7P40501 PRS2YER099C 957 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT7P40501 SYF2YGR129W 648 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT7P40501 HAP3YBL021C 435 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT7P40501 YPL102CYPL102C 303 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT7P40501 PRI2YKL045W 1587 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT7P40501 ADE12YNL220W 1302 nt5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms