Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZEB1P37275 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZEB1P37275 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZEB1P37275 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZEB1P37275 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZEB1P37275 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZEB1P37275 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZEB1P37275 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZEB1P37275 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZEB1P37275 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZEB1P37275 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ZEB1P37275 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ZEB1P37275 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ZEB1P37275 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZEB1P37275 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC35.13■■■■□ 3.22
ZEB1P37275 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms