Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDC2P34741 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDC2P34741 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDC2P34741 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDC2P34741 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDC2P34741 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDC2P34741 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDC2P34741 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SDC2P34741 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SDC2P34741 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SDC2P34741 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SDC2P34741 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDC2P34741 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDC2P34741 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDC2P34741 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDC2P34741 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDC2P34741 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDC2P34741 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDC2P34741 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDC2P34741 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDC2P34741 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDC2P34741 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDC2P34741 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDC2P34741 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDC2P34741 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDC2P34741 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDC2P34741 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDC2P34741 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDC2P34741 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDC2P34741 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDC2P34741 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDC2P34741 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDC2P34741 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDC2P34741 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDC2P34741 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDC2P34741 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDC2P34741 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDC2P34741 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDC2P34741 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDC2P34741 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDC2P34741 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDC2P34741 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDC2P34741 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDC2P34741 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDC2P34741 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDC2P34741 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDC2P34741 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDC2P34741 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDC2P34741 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDC2P34741 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDC2P34741 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDC2P34741 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDC2P34741 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDC2P34741 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDC2P34741 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDC2P34741 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDC2P34741 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDC2P34741 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDC2P34741 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDC2P34741 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDC2P34741 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDC2P34741 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDC2P34741 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDC2P34741 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDC2P34741 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDC2P34741 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDC2P34741 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDC2P34741 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SDC2P34741 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDC2P34741 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDC2P34741 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDC2P34741 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDC2P34741 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDC2P34741 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDC2P34741 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDC2P34741 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDC2P34741 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDC2P34741 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDC2P34741 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDC2P34741 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDC2P34741 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDC2P34741 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDC2P34741 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDC2P34741 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDC2P34741 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDC2P34741 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDC2P34741 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDC2P34741 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDC2P34741 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDC2P34741 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDC2P34741 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDC2P34741 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDC2P34741 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDC2P34741 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SDC2P34741 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDC2P34741 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDC2P34741 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDC2P34741 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDC2P34741 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDC2P34741 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms