Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNTFRP26992 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms