Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD9P21926 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD9P21926 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD9P21926 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD9P21926 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD9P21926 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD9P21926 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD9P21926 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CD9P21926 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CD9P21926 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD9P21926 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CD9P21926 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD9P21926 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD9P21926 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD9P21926 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD9P21926 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD9P21926 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD9P21926 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD9P21926 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD9P21926 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD9P21926 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CD9P21926 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD9P21926 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD9P21926 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD9P21926 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD9P21926 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD9P21926 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD9P21926 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD9P21926 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD9P21926 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD9P21926 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD9P21926 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD9P21926 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD9P21926 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD9P21926 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CD9P21926 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD9P21926 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD9P21926 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD9P21926 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD9P21926 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD9P21926 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD9P21926 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD9P21926 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD9P21926 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD9P21926 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD9P21926 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD9P21926 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD9P21926 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD9P21926 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD9P21926 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD9P21926 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD9P21926 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD9P21926 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD9P21926 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD9P21926 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD9P21926 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CD9P21926 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CD9P21926 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD9P21926 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD9P21926 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD9P21926 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD9P21926 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD9P21926 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD9P21926 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD9P21926 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD9P21926 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD9P21926 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD9P21926 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD9P21926 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD9P21926 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD9P21926 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD9P21926 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD9P21926 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD9P21926 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD9P21926 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD9P21926 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD9P21926 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CD9P21926 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD9P21926 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD9P21926 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD9P21926 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD9P21926 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD9P21926 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD9P21926 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD9P21926 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD9P21926 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD9P21926 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms