Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP3P21580 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP3P21580 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP3P21580 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP3P21580 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP3P21580 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFAIP3P21580 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP3P21580 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms