Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD247P20963 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD247P20963 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD247P20963 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD247P20963 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD247P20963 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD247P20963 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD247P20963 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD247P20963 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD247P20963 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD247P20963 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD247P20963 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD247P20963 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD247P20963 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD247P20963 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD247P20963 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD247P20963 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD247P20963 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD247P20963 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD247P20963 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD247P20963 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD247P20963 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD247P20963 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD247P20963 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD247P20963 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD247P20963 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD247P20963 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD247P20963 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD247P20963 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD247P20963 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD247P20963 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD247P20963 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD247P20963 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD247P20963 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CD247P20963 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD247P20963 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD247P20963 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD247P20963 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD247P20963 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD247P20963 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD247P20963 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD247P20963 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD247P20963 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD247P20963 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD247P20963 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD247P20963 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD247P20963 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD247P20963 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD247P20963 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD247P20963 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD247P20963 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD247P20963 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD247P20963 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD247P20963 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD247P20963 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD247P20963 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD247P20963 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD247P20963 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD247P20963 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD247P20963 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD247P20963 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD247P20963 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD247P20963 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD247P20963 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD247P20963 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD247P20963 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD247P20963 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD247P20963 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD247P20963 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD247P20963 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD247P20963 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD247P20963 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD247P20963 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD247P20963 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD247P20963 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD247P20963 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD247P20963 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD247P20963 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD247P20963 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD247P20963 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD247P20963 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD247P20963 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CD247P20963 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD247P20963 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD247P20963 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD247P20963 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD247P20963 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CD247P20963 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD247P20963 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD247P20963 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CD247P20963 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD247P20963 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD247P20963 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD247P20963 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD247P20963 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD247P20963 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD247P20963 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD247P20963 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD247P20963 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD247P20963 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms