Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD53P19397 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD53P19397 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD53P19397 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD53P19397 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD53P19397 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD53P19397 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD53P19397 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD53P19397 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD53P19397 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD53P19397 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD53P19397 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD53P19397 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD53P19397 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CD53P19397 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD53P19397 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD53P19397 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD53P19397 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD53P19397 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD53P19397 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD53P19397 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD53P19397 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD53P19397 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD53P19397 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD53P19397 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD53P19397 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD53P19397 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD53P19397 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD53P19397 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD53P19397 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD53P19397 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD53P19397 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD53P19397 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD53P19397 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD53P19397 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD53P19397 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD53P19397 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD53P19397 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD53P19397 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD53P19397 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD53P19397 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD53P19397 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD53P19397 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD53P19397 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD53P19397 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD53P19397 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD53P19397 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD53P19397 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD53P19397 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD53P19397 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD53P19397 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD53P19397 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD53P19397 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD53P19397 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD53P19397 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD53P19397 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD53P19397 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD53P19397 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD53P19397 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD53P19397 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD53P19397 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD53P19397 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD53P19397 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD53P19397 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD53P19397 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD53P19397 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD53P19397 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD53P19397 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD53P19397 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD53P19397 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD53P19397 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD53P19397 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD53P19397 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD53P19397 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD53P19397 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD53P19397 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD53P19397 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD53P19397 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD53P19397 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD53P19397 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD53P19397 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD53P19397 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD53P19397 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD53P19397 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD53P19397 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD53P19397 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD53P19397 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD53P19397 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD53P19397 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD53P19397 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD53P19397 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD53P19397 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD53P19397 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD53P19397 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD53P19397 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD53P19397 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD53P19397 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD53P19397 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD53P19397 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD53P19397 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms