Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2F2P13984 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2F2P13984 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms