Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COX4I1P13073 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms