Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM200BP0CF97 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM200BP0CF97 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM200BP0CF97 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms