Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPB2P08579 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPB2P08579 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPB2P08579 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms