Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRM2P04554 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRM2P04554 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRM2P04554 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRM2P04554 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRM2P04554 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRM2P04554 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRM2P04554 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRM2P04554 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRM2P04554 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRM2P04554 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRM2P04554 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRM2P04554 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRM2P04554 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRM2P04554 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRM2P04554 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRM2P04554 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRM2P04554 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRM2P04554 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRM2P04554 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRM2P04554 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRM2P04554 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRM2P04554 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRM2P04554 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRM2P04554 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRM2P04554 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRM2P04554 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRM2P04554 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRM2P04554 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRM2P04554 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRM2P04554 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRM2P04554 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRM2P04554 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRM2P04554 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRM2P04554 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRM2P04554 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRM2P04554 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRM2P04554 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRM2P04554 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRM2P04554 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRM2P04554 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRM2P04554 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRM2P04554 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRM2P04554 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRM2P04554 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRM2P04554 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRM2P04554 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRM2P04554 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRM2P04554 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRM2P04554 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRM2P04554 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRM2P04554 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRM2P04554 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRM2P04554 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRM2P04554 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRM2P04554 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRM2P04554 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRM2P04554 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRM2P04554 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRM2P04554 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRM2P04554 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRM2P04554 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRM2P04554 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRM2P04554 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRM2P04554 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRM2P04554 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRM2P04554 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PRM2P04554 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRM2P04554 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRM2P04554 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRM2P04554 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRM2P04554 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRM2P04554 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRM2P04554 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms