Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLIC3O95833 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLIC3O95833 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms