Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP12O75317 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP12O75317 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP12O75317 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP12O75317 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP12O75317 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP12O75317 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP12O75317 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP12O75317 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP12O75317 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP12O75317 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP12O75317 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP12O75317 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP12O75317 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP12O75317 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP12O75317 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP12O75317 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP12O75317 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP12O75317 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP12O75317 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP12O75317 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP12O75317 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP12O75317 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP12O75317 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP12O75317 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP12O75317 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP12O75317 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP12O75317 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP12O75317 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP12O75317 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP12O75317 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP12O75317 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP12O75317 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP12O75317 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP12O75317 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP12O75317 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP12O75317 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP12O75317 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP12O75317 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP12O75317 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP12O75317 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP12O75317 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP12O75317 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP12O75317 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP12O75317 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP12O75317 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP12O75317 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP12O75317 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP12O75317 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP12O75317 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP12O75317 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP12O75317 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP12O75317 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP12O75317 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP12O75317 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP12O75317 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP12O75317 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP12O75317 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP12O75317 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP12O75317 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP12O75317 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP12O75317 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP12O75317 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP12O75317 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP12O75317 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP12O75317 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP12O75317 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP12O75317 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP12O75317 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP12O75317 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP12O75317 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP12O75317 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP12O75317 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP12O75317 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP12O75317 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP12O75317 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP12O75317 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP12O75317 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP12O75317 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP12O75317 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP12O75317 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP12O75317 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP12O75317 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP12O75317 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP12O75317 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP12O75317 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP12O75317 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms