Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN2O75298 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN2O75298 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN2O75298 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN2O75298 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN2O75298 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN2O75298 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN2O75298 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN2O75298 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN2O75298 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN2O75298 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN2O75298 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN2O75298 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN2O75298 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN2O75298 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN2O75298 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN2O75298 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN2O75298 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN2O75298 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN2O75298 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN2O75298 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTN2O75298 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN2O75298 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN2O75298 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN2O75298 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN2O75298 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN2O75298 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN2O75298 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN2O75298 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN2O75298 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN2O75298 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN2O75298 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN2O75298 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN2O75298 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN2O75298 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN2O75298 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN2O75298 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN2O75298 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN2O75298 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN2O75298 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN2O75298 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN2O75298 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN2O75298 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN2O75298 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN2O75298 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN2O75298 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN2O75298 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN2O75298 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN2O75298 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN2O75298 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN2O75298 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN2O75298 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN2O75298 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN2O75298 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN2O75298 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN2O75298 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN2O75298 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN2O75298 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN2O75298 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN2O75298 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN2O75298 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN2O75298 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN2O75298 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN2O75298 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN2O75298 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN2O75298 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RTN2O75298 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN2O75298 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN2O75298 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN2O75298 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN2O75298 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN2O75298 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN2O75298 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN2O75298 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN2O75298 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN2O75298 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN2O75298 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN2O75298 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN2O75298 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN2O75298 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN2O75298 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN2O75298 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN2O75298 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN2O75298 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN2O75298 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms