Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR2O43760 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYNGR2O43760 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms