Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDN3O15551 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN3O15551 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN3O15551 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN3O15551 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms