Protein–RNA interactions for Protein: O15127

SCAMP2, Secretory carrier-associated membrane protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP2O15127 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAMP2O15127 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP2O15127 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP2O15127 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms