Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SOCS3O14543 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms