Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1FO00160 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1FO00160 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1FO00160 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1FO00160 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1FO00160 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1FO00160 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYO1FO00160 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MYO1FO00160 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYO1FO00160 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms