Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPSO00116 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPSO00116 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPSO00116 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPSO00116 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPSO00116 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPSO00116 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPSO00116 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPSO00116 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGPSO00116 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGPSO00116 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AGPSO00116 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPSO00116 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPSO00116 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPSO00116 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPSO00116 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPSO00116 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPSO00116 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPSO00116 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPSO00116 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPSO00116 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPSO00116 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPSO00116 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPSO00116 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPSO00116 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPSO00116 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPSO00116 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPSO00116 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPSO00116 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPSO00116 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPSO00116 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPSO00116 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPSO00116 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPSO00116 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPSO00116 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPSO00116 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPSO00116 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPSO00116 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AGPSO00116 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPSO00116 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPSO00116 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPSO00116 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPSO00116 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPSO00116 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPSO00116 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPSO00116 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPSO00116 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPSO00116 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPSO00116 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPSO00116 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPSO00116 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPSO00116 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPSO00116 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPSO00116 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPSO00116 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPSO00116 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPSO00116 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPSO00116 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPSO00116 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPSO00116 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPSO00116 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPSO00116 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPSO00116 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPSO00116 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPSO00116 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPSO00116 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPSO00116 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPSO00116 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPSO00116 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGPSO00116 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AGPSO00116 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGPSO00116 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGPSO00116 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGPSO00116 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGPSO00116 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGPSO00116 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGPSO00116 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGPSO00116 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGPSO00116 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGPSO00116 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGPSO00116 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGPSO00116 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGPSO00116 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGPSO00116 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGPSO00116 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGPSO00116 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGPSO00116 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGPSO00116 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGPSO00116 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGPSO00116 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGPSO00116 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGPSO00116 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGPSO00116 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGPSO00116 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AGPSO00116 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGPSO00116 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGPSO00116 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGPSO00116 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms