Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PP2D1A8MPX8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PP2D1A8MPX8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms