Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C4orf47A7E2U8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4orf47A7E2U8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf47A7E2U8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms