Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIPT2A6NK58 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIPT2A6NK58 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms