Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELTA6NFD8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms