Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCE3A1L190 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYCE3A1L190 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms