Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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