Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMED7Q9Y3B3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms