Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms