Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms