Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms