Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms