Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT172Q9UG01 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms