Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLKQ9UBT6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms