Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms