Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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