Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms