Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms