Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms