Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK19Q9BWU1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms