Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LPIN3Q9BQK8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms