Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms