Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD180Q99467 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD180Q99467 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD180Q99467 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD180Q99467 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD180Q99467 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD180Q99467 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD180Q99467 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms