Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms