Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms