Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms